<rp id="el4g3"><legend id="el4g3"></legend></rp>

  1. <b id="el4g3"><kbd id="el4g3"></kbd></b>

    <small id="el4g3"></small>

  2. <u id="el4g3"></u>
    科技動態
    首頁 - 科技動態
    2022-07-19 作者:化學化工學院 來源:科學技術處

    化學化工學院黃碩團隊報道高分辨納米孔精準分辨表觀遺傳學修飾

    RNA表觀遺傳學修飾越來越受到科學家們的重視,成為近來生命科學領域的研究熱點之一。迄今為止,在RNA上已經發現170多種表觀遺傳修飾,他們在基因調控mRNA剪接RNA折疊等生命過程中發揮著至關重要作用,還與癌癥、中風等人類疾病的發生密切相關。然而,目前主流的二代測序方法可檢測的修飾種類有限,且這些方法通常只能鑒定其中一種修飾類型,仍有大量RNA修飾無法被檢測或被定位。

    1: 利用高分辨MspA納米孔區分RNA核苷酸及其表觀遺傳學修飾

    近日,我校化學化工學院黃碩團隊構建了一種超高分辨的工程化納米孔,可以準確的識別所有RNA核苷酸和他們的主要修飾,包括5-甲基胞苷(m5C) N6 -甲基腺苷(m6A) N7 -甲基鳥苷(m7G) N1 -甲基腺苷(m1A),肌苷(I),假尿嘧啶(&Psi;)和二氫尿嘧啶(D)的完全區分與同時檢測,機器學習識別準確率高達99.6%。隨后研究團隊將該方法運用于天然RNA的表觀遺傳修飾鑒定,在免分離RNA消化產物中實現了修飾核苷酸的直接定量分析,成功繪制胃腸癌標志物miRNA和酵母tRNA的修飾圖譜。該研究方法適用于大量核苷酸、核苷酸修飾及核苷酸衍生物的檢測,為快速定量分析天然RNA中的表觀修飾提供高分辨單分子分析工具,并為發展邊酶切邊測序的納米孔RNA表觀遺傳測序提供了重要的設計策略和研究方法。

    2: 文章信息

    相關成果以"Identification of nucleoside monophosphates and their epigenetic modifications using an engineered nanopore"為題,于2022718日發表在《Nature Nanotechnology(自然納米技術)王玉琴、張善雨和賈文東為該論文共同第一作者,黃碩教授為論文通訊作者,陳洪淵院士對該工作做出了重要指導。研究受國家自然科學基金、江蘇省高層次創業創新人才引進計劃、江蘇省自然科學基金、中國博士后科學基金等經費資助完成。

    文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41565-022-01169-2

    DOIhttps://doi.org/10.1038/s41565-022-01169-2

    亚洲第一黄色网站不卡在线视频